為了保持剛捕撈上來的魚產品的新鮮度，漁船也有采用冷卻海水來冷卻魚產品。現在一般較大的漁船都設置冷卻系統，該制冷裝置可對一個或幾個船艙控制-1℃左右的冷卻海水。漁船捕獲的魚放入冷卻海水艙里，冷卻的海水就可對于進行冷卻，打到保險的目的。有時捕獲的魚較多，魚放入冷卻海水艙有是波動較大，有的漁船在出海前常常帶有一部分補充碎冰，需要時可將碎冰和鮮魚一起放入冷卻漁艙，使鮮魚得到迅速冷卻。其漁船補充水量，一般為魚貨數量的25%-35%，但也因船因制冷量而異。為了防止海水濃度被沖淡，在加冰同時加入適量食鹽，冷卻海水與魚貨的比例一般為3：7左右。如果設有幾個船艙冷庫的，一般對魚的品種進行分類存放。
目前每條幾百萬元至上千萬元的漁船都設置有制冷系統。該系統中設有管架或平板速凍、低溫儲藏間1-3間，有的還設置有冷卻海水艙，即采用低溫冷卻海水微凍保鮮。冷卻海水保鮮是將捕撈上來的魚放入溫度為零下1至零下5度的冷卻海水中進行保鮮的一種方法。冷海水可分為機制冷海水和冰制冷海水兩種。隨著漁船的不斷改個更新，目前采用機制冷海水較為普遍。冷海水保鮮是在船艙內海水預制鹽的含量為10%-12%的海水溶液。用制冷裝置降至-1—-5度把挑選的魚貨裝入放在冷海水艙內的網袋中進行微凍保鮮。魚體的中心溫度為正負0—-2度。冷海水魚的保鮮期約為20天以上。
冷海水保鮮的有優點是，魚貨冷卻速度快，用冷海水保鮮的魚貨不會失去天然的色澤和硬度，還能保持魚鰓的顏色和透明度，冷海水因有浮力，魚不會被擠壓受傷等。其缺點是魚體在海水中浸泡，因滲鹽吸水使魚體膨脹，魚肉略帶咸味，體表稍有變色，由于船身不停搖動會出現魚貨脫磷現象等。
漁船上的制冷裝置有氨制冷系統及氟利昂制冷系統兩種，使用氟利昂的較多一些。因漁船設備空間有限從安全角度考慮，因盡量采用氟利昂制冷系統。至今漁船上制冷裝置事故沒見報道，這跟采用氟利昂制冷劑有很大關系。另外由于漁船上的機艙溫度很高，空間較小，不管是采用氨制冷系統或氟利昂制冷系統，漁船機艙都應設置有良好的通風設備。
漁船上的制冷系統中的蒸發器大多采用無縫鋼管。目前在漁船上采用鋁合金管也發展迅速。不管采用鋁板或鋁管，造價遠遠比無縫鋼管高，有的經營者追求制冷速度快，并且又節能，仍有較多采用。漁船上的制冷系統，不管還是采用氨作為制冷劑還是采用氟利昂作為制冷劑，其使用、維修和管理大體上跟陸地上的冷庫一樣。 |
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